EPISÓDIO 01 - Piloto
Uma chuva de meteoros atinge a cidade de Smallville, e com ela vem também uma nave com um menino. Um casal fazendeiros, Martha e Jonathan Kent encontram-no e adotam-no. Doze anos depois, quando a história começa a ser contada, Clark Kent esta indo para o primeiro ano do Ensino Médio. É quando ele conhece Lex Luthor, após salva-lo de um acidente de carro, e os dois acabam se tornando bons amigos. É também quando seu pai lhe revela sua verdadeira identidade, e conta que ele veio de outro planeta, o que o deixa bastante chocado. Após um momento íntimo com Lana Lang, seu namorado, Whitney Fordman, força Clark a ser vítima de um sádico ritual tradicional da escola. Jeremy Creek, um adolescente que fora vítima desse mesmo ritual doze anos antes, e que entrou em coma após a chuva de meteoros, decide se vingar de quem fez isso com ele; e depois, tenta fazer o mesmo com todos os outros estudantes do Colégio de Smallville, mas Clark consegue detê-lo.

EPISÓDIO 02 - Metamorfose
Greg Arkin tem uma fixação por Lana, e possui o estranho gosto por colecionar insetos. Um dia, ele sofre um acidente de carro e é mordido por insetos infectados por meteoros, e acaba se tornando metade humano, metade inseto. Então ela escolhe Lana para fazer o acasalamento, e Clark e Withney vão tentar detê-lo. Clark luta contra Greg, e após derrotá-lo, vai buscar Lana, mas Whitney havia chegado antes dele, e acaba levando o crédito pelo salvamento. Nesse episódio, Lana descobre que Withney fez a brincadeira do espantalho com Clark (episódio anterior) e que perdeu seu colar preferido, ficando brava com ele. Lex acha o colar, e o entrega para Clark, dizendo que se ele der o colar de volta para Lana, ela vai se apaixonar por ele.

EPISÓDIO 03 - Pegando Fogo
É descoberto no Colégio de Smallville que sete alunos do time de futebol americano foram pegos colando num exame de matemática, e que o técnico do time, Arnold, foi quem forneceu a cola para eles. Os jogadores são suspensos do time, e, para suprir os desfalques, o técnico Arnold convence Clark a se juntar ao time, mesmo contra a vontade de seu pai. Porém, o técnico é um infectado, capaz de criar fogo, e comete atentados contra o diretor da escola, contra o aluno que o entregou, e contra Chloe Sullivan. Clark vai detê-lo, mas devido às pedras de meteoro, só consegue com a ajuda de seu pai. Lana desiste de ser líder de torcida, e decide arranjar um emprego. Lex desafia seu pai nos negócios, e consegue cortar os gastos da fábrica, como lhe fora ordenado, sem demitir nenhum funcionário.

EPISÓDIO 04 - Visões de Raio-X
Lex Luthor assalta um banco em Smallville, e durante a fuga, ele cruza com Clark. Quando Clark olha para ele, vê o esqueleto de Lex, com manchas verdes. Clark descobre que ele consegue ter visões de raio-x e enxergar através das coisas. Quando ele passa a conseguir controlar essa habilidade, ele descobre que Tina Greer consegue assumir a aparência de outras pessoas, e que foi ela quem assaltou o banco. Ela é obcecada por Lana, e pretende assumir o seu lugar. Quando Clark descobre isso, ele vai atrás delas, e consegue deixar Tina inconsciente, para que as autoridades a prendessem. Lana descobre que sua mãe, quando tinha sua idade, passava pelos mesmos conflitos internos que ela. Lex contrata Roger Nixon, um repórter do Inquisitor, para fazer uma investigação sobre o acidente em que ele e seu carro caíram da ponte, e Clark o resgatou.

EPISÓDIO 05 - Encontros
Durante uma festa no lago Crater, Sean Kelvin cai no lago congelado, onde havia pedras de meteoro, e quando consegue sair, ele não consegue reter o calor em seu corpo e precisa de doses constantes de calor humano para se aquecer, e por isso tira todo o calor de sua namorada, matando-a. Sean chama Chloe para um encontro. Clark, encorajado por Lex, decide convidar Lana para ir a um show com ele, como amigos. Quando os dois estavam a caminho do show, Clark vê a noticia que Sean matou sua namorada, e pensa que o mesmo pode acontecer com Chloe, e volta para trás para salvá-la, estragando assim seu encontro com Lana. No final, Clark consegue jogar Sean num lago, que congela imediatamente com ele dentro. Lex descobre que os Kents estão endividados, e se oferece para ajuda-los, financiando novos métodos de produção, mas Jonathan não confia nele, e prefere pedir um empréstimo no banco.

EPISÓDIO 06 - Destino
Clark conhece uma senhora idosa que ficou cega após a chuva de meteoros, chamada Cassandra Carver. Desde então, ela consegue ver o futuro das pessoas que ela toca. Clark se vê sozinho em seu futuro, com todos os que ele ama mortos. Lex decide visitá-la, e Cassandra, após ver cenas de um futuro com sangue caindo dos céus, acaba falecendo. Harry Bollston, um idoso que mora em um asilo, cai em um lago cheio de pedras de meteoro, e elas o fazem rejuvenescer. Ele decide então se vingar dos filhos dos membros do júri que o condenaram por assassinato décadas antes, sendo um deles o pai de Jonathan Kent. Quando ele vai até a fazenda, Jonathan não esta lá, então ele decide matar Martha primeiro. Clark chega a tempo de salvar sua mãe, e Harry acaba morrendo acidentalmente.

EPISÓDIO 07 - Desejo
Nell, tia de Lana, esta organizando uma festa de aniversário para a sobrinha na mansão Luthor. Withney é convidado para fazer um teste num time de futebol americano no mesmo dia da festa, e Lana fica sem par, mas Clark se oferece para acompanhá-la. Jodi Melville, cansada de ser gorda, decide criar sua própria dieta, que consiste em vegetais cultivados em um solo onde há fragmentos de meteoros. Ela começa a emagrecer rapidamente, e começa a perder peso muito rápido, e para compensar, precisa consumir gordura humana pra se satisfazer. Ela convida Pete Ross para acompanha-la na festa da Lana. Quando ele vai buscá-la para a festa, ela tem uma recaída, e decide comê-lo. Clark, que descobrira sobre sua misteriosa perda de peso, consegue chegar a tempo de salvar Pete, e por isso acaba faltando no seu compromisso com Lana. Lex decide investir nas pesquisas do cientista Dr. Hamilton sobre os efeitos das pedras de meteoros.

EPISÓDIO 08 - No Limite
A LuthorCorp está fazendo experiências com meteoros em um galpão secreto. Earl Jenkins, o funcionário encarregado de limpar o local, diz que houve uma explosão no local, e que os fragmentos do material que estava sendo estudado entrou em sua pele, fazendo ele ter tremedeiras constantes. Earl vai até a fábrica e tenta achar o local, mas a passagem para ele está obstruída. Alguns alunos do Colégio Smallville vão visitar uma fábrica da LuthorCorp, e Earl os toma como reféns, dizendo que só vai soltá-los se alguém o levar até o Nível 3 da fábrica, local onde ele diz ter acontecido a explosão. Lionel Luthor, pai de Lex, vai até a fábrica, e afirma não existir nenhum Nível 3. Lex decide entrar e conversar com Earl, dizendo que se ele libertar os reféns, ele vai leva-lo até o local. Clark desobstrui a passagem para o Nível 3. Quando eles chegam ao local, Eral tem outra crise de tremedeira, e Clark consegue salvar os dois. No final, Lex diz que a LuthorCorp vai bancar o melhor tratamento possível para Earl.

EPISÓDIO 09 - O Mau Caráter
Clark é convidado por Lex para ir a uma festa num museu em Metrópolis, e acaba impedindo um ônibus desgovernado de atropelar um mendigo que dormia na rua. A única pessoa que presencia o acidente é Sam Phelan, um policial corrupto de Metrópolis. Então ele chantageia Clark, dizendo que se ele não fizer uns serviços sujos para ele, ele vai contar ao mundo o seu segredo. Quando Clark se recusa a ajudá-lo, ele implanta provas para prender Jonathan Kent. Então ele manda Clark ajudá-lo a roubar uma valiosa peça do museu da LuthorCorp, mas Clark consegue fugir e fazer com que os seguranças o peguem em flagrante. Phelan leva um tiro dos seguranças do museu e morre se recusando a responder a Lex o que ele sabia sobre Clark. Chloe escreve uma tese polêmica no “Torch” e é censurada pelo diretor. Lana assume a diretoria do jornal, e Chloe acha que ela estava fazendo aquilo só por interesse. Ao final, a diretoria do jornal volta para Chloe e as duas fazem as pazes. Uma velha amiga de Lex, Victoria Hardwick, vai passar uns tempos na mansão.

EPISÓDIO 10 - O Mistério
Lana está organizando uma campanha de doação de sangue. Quando Whitney diz que não vai ajudá-la, Clark aproveita a chance para ajudá-la e se aproximar dela. Os dois chegam a quase se beijar, mas são interrompidos por Nell. Então, Clark descobre que o motivo pelo qual Whitney anda distante é porque seu pai está doente, e sente que não seria justo se aproveitar dessa situação para ficar com Lana, e acaba dizendo pra ela que ela deve apoiar Withney naquele momento difícil para ele. Amy Palmer é obcecada por Lex. Seus pais são empregados de Lex e vivem ao lado da mansão Luthor. Alguém descobre um pó que sai de uma planta que deixa as pessoas invisíveis, e ataca Victoria. Lex e Clark desconfiam que Amy foi a autora do ataque, mas depois que ela vai embora da mansão, descobre-se que o autor dos ataques é seu irmão, Jeff, que estava tentando ajudar a irmã. Ele tenta matar Lex, mas Clark consegue chegar em tempo de impedí-lo, e consegue prendê-lo.

EPISÓDIO 11 - O Aperto de Mão
Bob Rickman tem o poder de persuadir as pessoas com um simples aperto de mãos, e recebeu esse poder no dia em que caiu a chuva de meteoros, quando estava de passagem em Smallville. Ele quer construir uma fábrica em Smallville, e consegue convencer Jonathan Kent a vender a fazenda para ele. Clark descobre que Rickman tinha um parceiro, Kyle Tippet, que estava com ele durante a chuva de meteoros, e que tem esse mesmo poder. Porém Kyle buscou o exlílio desde então, com medo do que poderia acontecer se ele usasse seus poderes. Lana sofre um pequeno acidente com o cavalo, e Kyle, que estava passando pelo local na hora, tenta socorrê-la, mas Lana acha que foi ele quem provocou o acidente. Então, devido a uma diferença de opiniões sobre ele, Clark entra em conflito com Lana e Whitney. Clark procura a ajuda de Kyle, para deter Rickman, e esse usa suas habilidades para convencer Lex a matar os dois. Ao final, Clark e Kyle escapam, Kyle usa seus poderes para fazer Rickman cometer suicídio, e Lana faz as pazes com Clark.

EPISÓDIO 12 - O Sanguessuga
Durante uma aula de campo, Clark é atingido por um raio quando tentava impedir seu colega, Eric Summers, de cair do alto da barragem de uma represa, no momento em que Eric estava segurando uma pedra de meteoro. Com isso, os poderes de Clark são transferidos para Eric. Porém, os novos poderes de Eric lhe sobem à cabeça, e ele se descontrola. Clark decide confrontá-lo, e usando um pedaço de meteoro, combinado com um grande choque, consegue reverter o processo, recuperando seus poderes. Nell decide vender a loja e se mudar para uma menor, sob protestos de Lana, que alega que aquele foi o lugar em que seus pais se conheceram. Lex consegue dar um golpe e comprar a empresa de Sir Harry, pai de Victoria; e após ver Clark machucado, se convence de que ele é uma pessoa normal como todas as outras, e manda parar as investigações sobre ele e sobre o acidente no qual Clark o salvou.

EPISÓDIO 13- Cinético
Withney, após perder sua bolsa de estudos como jogador de futebol, começa a sair com um grupo que caras que também eram jogadores no Colegial e perderam suas bolsas. Eles usam pedras de meteoros para fazerem tatuagens, e elas lhes dão a habilidade de passar por objetos sólidos. Eles roubam um cofre da mansão Luthor, levam um disquete com arquivos confidencias de Lex, e Chloe acaba se ferindo, pois Clark não consegue chegar a tempo de impedí-la de cair da janela. Eles recrutam Withney para ajudá-los em seus roubos, então, Withney muda de ideia, e pede ajuda para Clark. Clark, Whitney e Lex, que estava sendo chantageado pelos ladrões, juntam forças e conseguem prender o grupo. Lana consegue convencer Lex a abrir um café no prédio do Talon, ao invés de demolí-lo para fazer um estacionamento, e se oferece como sócia.

EPISÓDIO 14 - Volta ao Passado
Três anos atrás, Lex acompanhou uma amiga sua, Amanda, a uma boate com a intenção de que ela flagrasse seu noivo, Jude Royce, com outras mulheres e assim terminasse com ele. Porém, quando Amanda termina com ele, ele vai atrás de Lex, esfaqueia-o, e em seguida leva um tiro e morre. Lex diz para um policial corrupto amigo seu que foi ele quem atirou, mas eles subornam as testemunhas e mudam a versão dizendo que foi o segurança da boate quem atirou. Agora, Jude está misteriosamente de volta, e quer saber quem realmente atirou nele aquele dia. Então, Lex descobre que quem esta por trás disso tudo na verdade é o irmão de Amanda, pois dois anos após aquele episódio, ela se matou, porque considerava Jude o amor de sua vida, e seu irmão culpa Lex pelo que aconteceu. Lex conta para ele que, na verdade, quem atirou em Jude foi Amanda, mas ele não acredita e tenta matar Lex. Clark consegue chegar a tempo de impedí-lo. Chloe pesquisa sobre o passado de Clark e descobre que a instituição que fez a sua adoção funcionou por apenas seis meses e que a única adoção realizada por ela foi a de Clark. O Talon é inaugurado com sucesso.

EPISÓDIO 15 - A Flor
Dr. Hamilton, em uma de suas experiências, borrifa uma concentração de meteoro e consegue ressuscitar uma planta extinta há muito tempo. Porém, quem respira o ar exalado por essa planta perde as inibições e começa a agir seguindo os instintos. Após algum tempo, a pessoa contaminada entra em coma e, mais tarde, morre. Jonathan, Lana e Pete Ross são contaminados. Lana dá em cima de Clark enquanto está alterada. Mais tarde, Lex e Hamilton conseguem encontrar um livro que descreve como preparar um antídoto contra o veneno da flor, e salvam todos os contaminados.

EPISÓDIO 16 - Perdido
Ryan Kelley é um garoto com poderes psíquicos, e pode ler a mente das pessoas. Ele é explorado por seu padrasto e a namorada dele, que o forçam a ajudá-los a cometerem crimes. Então, ele foge e é achado por Martha Kent, e vai morar provisoriamente com os Kent, tentando fugir de seu padrasto. Porém, ele é encontrado, e ao se recusar a ajudá-los de novo, seu padrasto tenta matá-lo, mas Clark consegue salvar Ryan. Lionel Luthor convida Lex para voltar a Metropollis, mas Lex decide continuar em Smallville.

EPISÓDIO 17 - O Anjo da Morte
Tyler Randall decide tentar ajudar sua mãe, em estado terminal, a morrer, porém é flagrado pelos seguranças do hospital, e acaba caindo da janela e morrendo. Porém ele ressuscita, com a habilidade de, com um simples toque, tirar a vida de uma pessoa. O pai de Whitney sofre outro infarto, e Tyler, ao ficar sabendo da história, acredita que estará ajudando ele e sua família acabando com seu sofrimento, mas Clark, ao descobrir suas intenções, consegue chegar a tempo de impedí-lo. No final, Tyler, envergonhado do que fez, decide tirar sua própria vida. Lionel Luthor manda um funcionário seu investigar os gastos de Lex em Smallville, como punição por ele não ter aceitado seu convite para voltar a Metropollis.

EPISÓDIO 18 - A Eleição
As eleições para presidente de classe se aproximam e Pete encoraja Clark a concorrer. Porém uma das candidatas, Sasha Woodman, é capaz de controlar abelhas, e, não aceitando a possibilidade da derrota, decide atacar todos os outros candidatos através das abelhas. Chloe decide apoiar outro candidato ao invés de Clark, pois o considera mais preparado do que Clark para ser presidente. Ao final, as abelhas acabam se voltando contra Sasha, e Clark acaba salvando-a. Ele acaba perdendo a eleição para o candidato que Chloe apoiou. O Talon começa a perder todos os seus fregueses para um concorrente, mas Lana descobre irregularidades de higiene no outro estabelecimento, e o denuncia, fazendo com que os fregueses voltem ao Talon. O pai de Lex manda uma repórter do Planeta Diário escrever um artigo sobre o filho, visando destruir a imagem de Lex. Quando Lex vê o artigo, ele faz uma troca com ela: ela desistiria de publicar o artigo, e ele, usando de suas influências, lhe conseguiria uma vaga como editora no jornal.

EPISÓDIO 19 - Telecinésia
Após ser atropelado em um acidente de carro, Justin Gaines ganha poderes de telecinésia, conseguindo manipular os objetos a sua volta. Ele se aproxima de Chloe, e ela o ajuda a descobrir quem o atropelou. É descoberto que o carro que o atropelou pertence ao Diretor Kwan; e Justin imediatamente vai atrás dele, e o mata. Porém, quem o atropelou na verdade foi o filho do diretor, e quando Chloe descobre que Justin matou o diretor, ele tenta matá-la, mas Clark consegue chegar a tempo de impedí-lo. Clark descobre que Chloe gosta dele. O pai de Whitney, que estava lutando contra problemas do coração, morre.

EPISÓDIO 20 - Oculto
Uma explosão perto em um lugar onde havia pedras de meteoro dá a Lana a habilidade de enxergar através dos olhos de um policial, que estava perto dela na hora da explosão. Ele seqüestra Chloe, para depois ganhar a fama por resgatá-la. Porém, com a ajuda de Lana, Clark consegue salvá-la. Quando o policial fica sabendo de sua conexão com Lana, ele decide matá-la, mas Clark novamente obtém sucesso no salvamento. Ao final, o policial acaba sendo morto por membros da própria polícia. Withney convida Lana para o baile da primavera; e Clark convida Chloe. Lex ouve a história de um homem que diz ter visto uma nave aterrisando em um campo durante a chuva de meteoros, e após fazer escavações no local indicado, encontra um disco octogonal formado por um material que não existe na Terra.

EPISÓDIO 21 - Tempestade
Lionel Luthor decide fechar a fábrica da LuthorCorp em Smallville, para obrigar Lex a voltar para Metrópolis. Lex decide então comprar a fábrica, com a ajuda dos funcionários, mas Lionel começa a criar vários obstáculos para ele. Roger Nixon, repórter do Inquisitor, descobre o segredo de Clark e diz que vai contar ao mundo seu segredo. Whitney decide se alistar para os fuzileiros navais, vai embora de Smallville e pede para que Lana espere que ele volte. Clark leva Chloe ao baile, porém durante a festa, chega a notícia de que um tornado esta se aproximando da cidade. Clark acha que Lana está no local onde o tornado vai passar, pois é perto da rodoviária onde ela foi se despedir de Withney, e sai correndo do baile para ver se ela está bem. Quando ele a encontra, ela está dentro do carro, que está sendo levado pelo tornado.